В фильме Лило и Стич зрители знакомятся с трогательной историей маленькой девочки Лило Пелекаи, которая живет на солнечном Гавайском острове Кауаи. После трагической гибели родителей забота о шестилетней Лило полностью ложится на плечи ее старшей сестры Нани. Молодая девушка вынуждена много работать, чтобы обеспечить их скромное существование, из-за чего Лило часто остается в одиночестве и чувствует себя непонятой окружающими.
Однажды соседка предлагает Нани неожиданное решение - взять из приюта собаку, чтобы составить компанию младшей сестре. Однако судьба приготовила им совершенно особенного питомца. Вместо обычной собаки Лило находит забавное синее существо по имени Стич, который на самом деле является инопланетным экспериментом, сбежавшим с космического корабля.
Лило и Стич рассказывает о том, как эти двое совершенно разных существ находят друг в друге родственные души. Девочка, мечтающая о настоящем друге, и инопланетянин, созданный для разрушения, открывают для себя силу настоящей семьи. Их необычная дружба проходит испытания не только земными проблемами, но и космическими охотниками, преследующими Стича.
Фильм показывает, что семья - это не только кровные узы, но и те, кто принимает тебя таким, какой ты есть, несмотря на все твои недостатки и странности.